این بخش از جمه بخشایی فعال بیمارستان با درصد اشغل تخت 72% می باشد که از سال 1371 افتتاح شده در حال حاضر این بخش در طبقه پنجم بيمارستان جای گرفته و یکي از مجهزترین مراکز مراقبت ویژه در منطقه و در سطح دانشگاه میباشد که همکاری خوبی با دانشگاه علوم پزشکی در امر پذیرش نوزادان مراقبت ویژه داشته است . حضور پزشکان مقیم در تمام شیفت ها دراین بخش منجر به افرایش ارتقای سطح درمانی در این بخش شده است .  پذیرش نوزادان در این بخش در دو سطح داخلی (زایشگاه ،اتاق عمل ،اورژانس ) و خارجی (از طریق اعزام و یا مرجعه بیماران و یا ارجاع از مطب و درمانگاه ) انجام می شود . حصور کادر پرستاری مجرب و دوره دید جهت این بخش و کادر پزشکی ماهر و متعهد (حضور یک فوق تخصصی جراحی نوزاد و 9 پزشک متخصص نوزادان و فوق تخصص نوزادان) از جمله نکات قابل طرح در این بخش می باشد .

این بخش از جمله بخشهايی فعال بیمارستان با درصد اشغال تخت 75% می باشد که از سال 1376 افتتاحی شده است . در حال حاضر این بخش در طبقه دوم بیمارستان جای گرفته و یکی ازمجهزترین مراکز مراقبت ویژه در سطح استان ميباشد که همکاری خوبی نیز با دانشگاه علوم پزشکی در امر پذیرش بیماران مراقبت ویژه داشته است . حضور پزشکان مقیم در تمام شیفت ها منجر به افزایش ارتقاءسطح درمانی درا ین بخش شده است . پذیرش بیماران در این بخش در دو سطج داخلی و اتاق عمل قلب باز و اعصاب ، اتاق عمل مرکزی ، بیماران بد حال بخشها و اورژانس و سطح خارجی از طریق پذیرش از مراکز درمانی دیگر یا هماهنگی ستاد هدایت می باشد . حضور کادر پرستاری مجرب و دوره دیده جهت این بخش و کادر پزشکی ماهر و متخصص به تعداد 10 نفر از جمله نکات قابل مطرح در این بخش می باشد

بخش  قلب و CCU بیمارستان موسی بن جعفر (ع)  در بهمن ماه سال 1370 با 6 تخت سي سي يو و 12 تخت تخت قلب در طبقه اول بيمارستان افتتاح گردید  . پزشکان بخش CCU نیز 3 نفر متخصص داخلی قلب می باشند که ویزیت روزانه بیماران را انجام داده و در قسمت اکوکاردیوگرافی نیز فعالیت داشته و مسئولیت بیماران تست ورزش را در شیفت صبح عهده دار می باشند .

بخش جراحی  اعصاب و جراحي چشم یکی از بخشهای تخصصی بیمارستان موسی بن جعفر(ع) میباشد این بخش در طبقه دوم بیماستان واقع شده است و یکی از مزایای مهم این بخش هم جواری با بخش مراقبت های ویژه (ICU  ) و اتاق عمل اعصاب میباشد . بخش جراحی اعصاب وچشم شامل دو قست اتاقهای عمومی و خصوصی میباشد ، تعداد تخت های عمومی 24 تخت و تعداد تخت خصوصی 6 تخت ميباشد . درمورد درصد اشغال تخت های این بخش باید گفت با توجه به حضور پزشکان متخصص و دانشگاهی و همچنین کادر پرستاری با تجربه و ماهر که با کلیه مراقبت های قبلی و بعد از عمل جراحی اعصاب و چشم آگاه و آشنا هستند از طرفی پایین بودن هزینه های درمانی این مرکز را با توجه به خیریه بودن آن نسبت به سایر مراکز درمانی مراجعه کنندگان بسیاری از شهرهای دور و نزدیگ را نیز پذيرا مي باشد . در مجموع باید گفت که درصد اشغال تخت در بخش حدود 50% است . انواع عملهای جراحی که در این بخش صورت می گیرد شامل عمل های جراحی ديسک و فیروژن کمر ، تومور مغز شنت های مغزی ، ترمیم عصب دست و جراحی های چشم (کارتاراکت ، گلوکوم ) میباشد .

در بهمن ماه 1390 در راستاي افزايش كيفيت و مراقبت بيشتر از كودكان در جوار بخش آي سي يو نوزادان طبقه پنجم تاسیس شد . اين بخش دارای شش اتاق 6 تخته مي باشد . . اتاق مخصوص بازی کودکان، اتاق مخصوص استراحت مادران از نكات رفاهي اين بخش ميباشد .

بخش زنان و زایمان از بخش های فعال بیمارستان موسی بن جعفر (ع) است که در طبقه چهارم بیمارستان واقع شده است یکی از مشخصات این بخش همجواری با بخش زایشگاه می باشد این بخش شامل دو قسمت عمومی و خصوصی است تعداد تخت های این بخش 50 تخت است که شامل 38 تخت در بخش عمومی و 12 تخت در بخش خصوصی ميباشد . اتاق نوزاد سالم جهت کنترل نوزادان واجرای طرح RI  و اتاق بیماران تحت نظر شامل بیماران درمان طبی،دیابتی،ویا حاملگی و..وجود اتاق مجهز پره اکلامپسی جهت بیماران فشارخون بالا، حضور پرستار و ماما مجرب و كار آمد در کلیه شیفت ها جهت کنترل مادران باردار و کنترل بیماران پس از زایمان و سزارین و پرستار مخصوص نوزادان طبیعی جهت کنترل و آموزش شیردهی و کنترل نوزادان از ويژگيهاي اين بخش ميباشد

این بخش در طبقه سوم بیمارستان واقع گردیده که شامل بخش عمومی با 24 تخت و هشت اطاق خصوصی می باشد  . فعالیت این بخش در زمینه جراحی های عمومی ، ارتوپدی ،ارولوژی ، زنان ، ENT بوده که با درصد ضریب اشغال تخت 48% از جمله بخشهای فعال بیمارستان محسوب میگردد. حضور کادر و پرسنل مجرب و آموزش دیده در سطوح پرستاری و کمک پرستاری نیز ار ویژگیهای مفید این بخش می باشد

بخش همودیالیز بیمارستان خیریه موسی بن جعفر(ع) در تیرماه سال 1377 به همت حاج اقای صاحبکار و سایر مسئولین و خیّرین با پنج دستگاه فرزتیوس با سیسم استات در طبقه چهارم در دو شیفت صبح وعصر شورع بکار کرد مسئلین فنی بخش جناب آقای دکتر مجاهدی و جناب اقای دکتر اقدم می باشند در سال 1380 به منظور گسترش بخش و اضافه شدن سه دستگاه فرزنیوس با سیستم بکربنات به طبقه همگف منتقل شد فعلا روزهای زوج در دو شیفت صبح و عصر و روزهای فرد در سه شیفت صبح و عصر و شب بیماران بطور سرپائی دیالیز می شودند . تعداد بیماران دائمی که مبتلا به نارسائی مزمن کلیه اند و در لیست پیوند کلیه مباشند 30 نفر هستند، این بیمارستان به زوار مسافر هم سرویس دهی مي رساند .درحال حاضر هفت دستگاه فعال وجود دارد و یک دستگاه ذخیره که در صورت خرابی تا رسیدن تکنسین مربوطه وقفه ای در درمان بیماران پیش نیاید . در سال 1388 بعلت فرسودگی دستگاه ها سه دستگاه گامبر و AK95  خریداری و جایگزین دستگاه های فرسوده شده است بخش شامل اتاق RO می باشد که سیستم (ریورس اسنر RO ) از کیش می باشد . همچنین بعد از اینکه آب از سخت گیر و فیلر کربن میگذرد و از دستگاه RO  بصورت آب مقطر توسط پمپ آب با شار دو اتمسفر به بخش و دستگاهها وارد میشود . که قابل استفاده برای بیماران ميباشد بخش دارای اکسیژن و ساکشن سانترال می باشد همچنین دستگاه الکترکاردیوگرام و ترایلی اورژانس میباشد بخش دارای اتاق نهار خوری و رختکن بیماران مرد و زن میباتشد بیماران دو وعده غذاييی دارند ،صبحانه و نهار _نهارو شام ،  این بیمارستان با کمیته امداد ، ارتش ، خدمات درمانی ، برای دیالیز قرارداد دارد و از بیماران وجهی گرفته نمیشود و از بیمه های مربوطه وجه دریافت می شود.

بخش اورژانس از بخش های فعال بیمارستان موسی بن جعفر می باشد که در جوار ساختمان بیمارستان و درطبقه همکف ساختمان درمانگاه واقع شده است که ارائه دهنده کلیه خدمات درمانی جهت بیماران اورژانسی می باشد با توجه به وجود بخش CCU در بیمارستان ، اورژانس پذیرای بیماران قلبی نیز می باشد که در صورت نیاز پس از انجام اقدامات اولیه و Stable شدن بیمار در صورتی که بیمار نیاز به بستری شده در بخش ccu داشته باشند با هماهنگی به بخش ICU انتقال می یابد ، بخش اورژانس دارای اطاق ایزوله ، اطاق عمل اورژانس ،اطاق CPR و 5 تخت جهت پدیرش بیمارن بزرگسال ، یکتخت جهت اطفال ، 2 تخت جهت تزریقات و 1 تخت جهت پانسمان میباشد ،در طول 24 ساعت یک پزشک عمومی دربخش اورژانس حضور دارد .

این بخش در مجاورت اتاق عمل مرکزی در طبقه اول بیمارستان واقع شده و با هدف ارتقاء سطح سلامت بیماران یکی از ارکان پایه ایی بیمارستان است  که کار گندزدایی و استریل سازی وسایل مرتبط با سلامت بیمارن را بهعده دارد . در دو شیفت صبح و عصر این بخش جوابگوی نیاز های بیمارستان می باشد csr شامل قسمتهای ورود وسایل کثیف و خروج وسایل تمیز می باشد که کلیه ست های اتاق عمل مرکزی به این قسمت وارد شده پس از شستشو و مراحل گند زدایی خشک شده و در قسمت دیگر بسته بندی میشود سپس وسایل استریل شده و در قفسه قسمت تمیز نگهداری میشود و از آنجا تحویل بخشهای مربوطه داده میشود بررسی و کنترل استریلیزاسیون و عملکرد اتوکلاوه ها از طریق 1.    استفاده از تست های B.D در شروع روز کاری 2.    استفاده از تست های بیوشیمیایی کلاس 4 و 6  در داخل پگ شاهد و کلیه ست های ورودی به اتوکلاو 3.    مونیتورینگ میکروبی با هدف سنجش کیفی عملکرد دستگاه های اتوکلاو که بصورت هفتگی انجام میشود

زایشگاه این بیمارستان  از تاریخ 16/5/ 1372 شروع بكار کرد . هدف از افتتاح این واحد در این بیمارستان خیریه ، رضایت و تکریم بیمارانی بود که علاوه بر نداشتن تمکن مالی با امید به ساحت مقدس حضرت موس بن جعفر (ع)  ، جهت تولد فرزند خود با این مرکز مراجعه می کردند با این هدف و منظور به مرور زایشگاه بیمارستان پذیرای بیماران بیشتری بود تا اینکه با توجه به استقبال و مجاوران و زائران بارگاه ملکوتی ثامن الحج (ع)  ازاین واحد بیمارستان باعث گردید تا مدیران محترم درصدد افزایش فضا و تجهیزات زایشگاه برآیند که این مهم در 22 خرداد 1387 تحقق یافت و فضای فعلی در طبقه چهارم واقع شده به این قسمت اختصاص یافت . فضای کنونی علاوه بروسعت در همجواری با بخش زنان 1 و خصوصی زنان میباشد که باعث سهولت  کار پرسنل و پزشکان محترم و همچنین راحتی بیماران عزیز شده است زایشگاه بیمارستان هم اکنون با آمار بالای 1000 زایمان درماه یکی از مراکز مهم در شهر مشهد در رابطه خدمت رسانی به هموطنان عزیز می باشد . در راستای اهداف روبه رشد بیمارستانی و اهداف وزارت بهداشت درمان مبني بر كاهش سزارين بيمارستان مصمم است تا مرکز زایمان بدون درد را نیز در زایشگاه فعال کنند . ودر رابطه با افزايش زايمان طبيعي مبادرت به آموزش مادران در بيمارستان نموده است. در حال حاضر زايشگاه بيمارستان با 38 پزشك و 21 پرسنل مجرب مامايي و امكانات روز يكي از بيمارستانهاي مورد اعتماد مشهد مي باشد.

از آنجاکه بیمارستان دارای بخشهای تخصصی قلب و CCU و همچنین اتاق عمل قلب باز بوده است همواره کمبود واحد آنژیوگرافی احساس می گردید که این موضوع بارها مورد درخواست مسئولین واحدها قرار گرفته بود اما از آنجاکه بیمارستان از نظر فضا و بودجه دارای محدودیتهایی می باشد . لذا امکان فراهم کردن آن میسر نگردیده بود تا اینکه با همت مدیر عامل محترم بانک پاسارگاد تامین بخشی از هزینه های این واحد را به عهده گرفت . هیئت مدیره بیمارستان نیز بر آن شدند تا با راه اندازی آنژیوگرافی چرخه درمان بیماران قلبی را کامل نمایند . لذا از سال 1391 طرح مطالعاتی و ساخت فضای فیزیکی مورد نیاز آن شروع و پس از اخذ موافقت اصولی و مجوزهای لازم ، بیمارستان اقدام به نصب دستگاه و تکمیل پروژه نمود که پس از طی مراحل آزمایشی و انجام کنترلهای لازم از طرف دانشگاه ، بهداشت محیط و سازمان انرژی اتمی و اخذ تایدیه های لازم بالاخره از رتبه های اردیبهشت 93 طور رسمی این واحد شروع به فعالیت نموده و توسط پزشکان خوشنام و متعهد این شهر اداره می گردد . لازم به ذکر است در این بخش اعمال آنژیوگرافی – آنژیوپلاستی – والوپلاستی شامل : * عروض کرونر - عروق محیطی- عروض کاروتید * تشخیص و درمان بیماریهای مادرزادی قلب * تشخیص و درمان بیماریهای دریچه ای قلب * تشخیص و درمان قلب و عروق با سلولهای بنیادی

از بخشهای فعال بیمارستان می باشد که در طبقه سوم بیمارستان در مجاورت بخش جراحی عمومی قرار گرفته است و از سال 1373 بصورت فعال پذیرش بیماران جراحی زنان – بیماران سزارین – زایمان طبیعی – سرکلاژ- کورتاژ و درمان طبی بوده است شامل شش اتاق 6 تخته بوده که از تجهیزات وامکانات مناسب بهره مند می باشد علاوه بر آن دارای اتاق نوزادان – اتاق NST- انبار ملحفه رختکن بیماران- انبار داروئی – نمازخانه – اتاق غذاخوری پرسنل- اتاق کار- دستشویی و حمام می باشد . از ویژگی های این بخش وجود ماما بعنوان نرس نوزاد در شیفت های صبح و عصر جهت کنترل بیماران پس از زایمان و سزارین و نوزادان طبیعی و همچنین کنترل و آموزش شیردهی نوزادان می باشد

بیمارستان دارای 10 اتاق عمل در دو طبقه مجزا سات ، 6 اتاق عمل اختصاص به عمل های جنرال دارد که در طبقه اول بیمارستان است و 4 اتاق عمل تخصصی در طبقه دوم واقع شده که عمل های قلب و اعصاب و چشم در آنجا انجام میشود .

اتاق عمل جنرال یا مرکزی

در سال 1371 جزو اولین بخشهای بود که در بیمارستان راه اندازی شده و عمل های جراخی زنان و جراحی عمومی ، ارتوپدی ،ارولوژی و گوش و حلق و بینی در آن انجام میشود .درحال حاضر 60 جراحان متخصص و15متخصص بیهوشی مشغول به کار هستند .

اتاق عمل تخصصی

این اتاق عمل در سال 1376 با همت حاج آقای صاحبکار  و جناب آقای پرفسور صادقی راه اندازی و تجهیز شد که شامل 2 اتاق عمل جهت جراحی قلب و 2  اتاق عمل دیگر جهت عمل های جراحی اعصاب و چشم ميباشد .  .

اتاق ها مجهّز به اکسیژن ساکشن سانترال می باشد.